Single-Round Patterned DNA Library Microarray Aptamer Lead Identification
المؤلفون المشاركون
Martin, Jennifer A.
Mirau, Peter A.
Chushak, Yaroslav
Chávez, Jorge L.
Naik, Rajesh R.
Hagen, Joshua A.
Kelley-Loughnane, Nancy
المصدر
Journal of Analytical Methods in Chemistry
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-05-14
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
A method for identifying an aptamer in a single round was developed using custom DNA microarrays containing computationally derived patterned libraries incorporating no information on the sequences of previously reported thrombin binding aptamers.
The DNA library was specifically designed to increase the probability of binding by enhancing structural complexity in a sequence-space confined environment, much like generating lead compounds in a combinatorial drug screening library.
The sequence demonstrating the highest fluorescence intensity upon target addition was confirmed to bind the target molecule thrombin with specificity by surface plasmon resonance, and a novel imino proton NMR/2D NOESY combination was used to screen the structure for G-quartet formation.
We propose that the lack of G-quartet structure in microarray-derived aptamers may highlight differences in binding mechanisms between surface-immobilized and solution based strategies.
This proof-of-principle study highlights the use of a computational driven methodology to create a DNA library rather than a SELEX based approach.
This work is beneficial to the biosensor field where aptamers selected by solution based evolution have proven challenging to retain binding function when immobilized on a surface.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Martin, Jennifer A.& Mirau, Peter A.& Chushak, Yaroslav& Chávez, Jorge L.& Naik, Rajesh R.& Hagen, Joshua A.…[et al.]. 2015. Single-Round Patterned DNA Library Microarray Aptamer Lead Identification. Journal of Analytical Methods in Chemistry،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1067167
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Martin, Jennifer A.…[et al.]. Single-Round Patterned DNA Library Microarray Aptamer Lead Identification. Journal of Analytical Methods in Chemistry No. 2015 (2015), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1067167
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Martin, Jennifer A.& Mirau, Peter A.& Chushak, Yaroslav& Chávez, Jorge L.& Naik, Rajesh R.& Hagen, Joshua A.…[et al.]. Single-Round Patterned DNA Library Microarray Aptamer Lead Identification. Journal of Analytical Methods in Chemistry. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1067167
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1067167
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر