Annotating the Function of the Human Genome with Gene Ontology and Disease Ontology
المؤلفون المشاركون
Jin, Shuilin
Hu, Yang
Zhou, Wenyang
Ren, Jun
Dong, Lixiang
Cheng, Liang
Wang, Yadong
المصدر
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-08-22
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Increasing evidences indicated that function annotation of human genome in molecular level and phenotype level is very important for systematic analysis of genes.
In this study, we presented a framework named Gene2Function to annotate Gene Reference into Functions (GeneRIFs), in which each functional description of GeneRIFs could be annotated by a text mining tool Open Biomedical Annotator (OBA), and each Entrez gene could be mapped to Human Genome Organisation Gene Nomenclature Committee (HGNC) gene symbol.
After annotating all the records about human genes of GeneRIFs, 288,869 associations between 13,148 mRNAs and 7,182 terms, 9,496 associations between 948 microRNAs and 533 terms, and 901 associations between 139 long noncoding RNAs (lncRNAs) and 297 terms were obtained as a comprehensive annotation resource of human genome.
High consistency of term frequency of individual gene (Pearson correlation = 0.6401, p = 2.2 e - 16 ) and gene frequency of individual term (Pearson correlation = 0.1298, p = 3.686 e - 14 ) in GeneRIFs and GOA shows our annotation resource is very reliable.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Hu, Yang& Zhou, Wenyang& Ren, Jun& Dong, Lixiang& Wang, Yadong& Jin, Shuilin…[et al.]. 2016. Annotating the Function of the Human Genome with Gene Ontology and Disease Ontology. BioMed Research International،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1097675
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Hu, Yang…[et al.]. Annotating the Function of the Human Genome with Gene Ontology and Disease Ontology. BioMed Research International No. 2016 (2016), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1097675
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Hu, Yang& Zhou, Wenyang& Ren, Jun& Dong, Lixiang& Wang, Yadong& Jin, Shuilin…[et al.]. Annotating the Function of the Human Genome with Gene Ontology and Disease Ontology. BioMed Research International. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1097675
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1097675
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر