![](/images/graphics-bg.png)
Reconstruction of the Fatty Acid Biosynthetic Pathway of Exiguobacterium antarcticum B7 Based on Genomic and Bibliomic Data
المؤلفون المشاركون
Silva, Artur
Ramos, Rommel
Kawasaki, Regiane
Baraúna, Rafael A.
Carepo, Marta S. P.
Oliveira, Rui
Marques, Rodolfo
Schneider, Maria P. C.
المصدر
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-08-09
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Exiguobacterium antarcticum B7 is extremophile Gram-positive bacteria able to survive in cold environments.
A key factor to understanding cold adaptation processes is related to the modification of fatty acids composing the cell membranes of psychrotrophic bacteria.
In our study we show the in silico reconstruction of the fatty acid biosynthesis pathway of E.
antarcticum B7.
To build the stoichiometric model, a semiautomatic procedure was applied, which integrates genome information using KEGG and RAST/SEED.
Constraint-based methods, namely, Flux Balance Analysis (FBA) and elementary modes (EM), were applied.
FBA was implemented in the sense of hexadecenoic acid production maximization.
To evaluate the influence of the gene expression in the fluxome analysis, FBA was also calculated using the log2FC values obtained in the transcriptome analysis at 0°C and 37°C.
The fatty acid biosynthesis pathway showed a total of 13 elementary flux modes, four of which showed routes for the production of hexadecenoic acid.
The reconstructed pathway demonstrated the capacity of E.
antarcticum B7 to de novo produce fatty acid molecules.
Under the influence of the transcriptome, the fluxome was altered, promoting the production of short-chain fatty acids.
The calculated models contribute to better understanding of the bacterial adaptation at cold environments.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Kawasaki, Regiane& Baraúna, Rafael A.& Silva, Artur& Carepo, Marta S. P.& Oliveira, Rui& Marques, Rodolfo…[et al.]. 2016. Reconstruction of the Fatty Acid Biosynthetic Pathway of Exiguobacterium antarcticum B7 Based on Genomic and Bibliomic Data. BioMed Research International،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1098871
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Kawasaki, Regiane…[et al.]. Reconstruction of the Fatty Acid Biosynthetic Pathway of Exiguobacterium antarcticum B7 Based on Genomic and Bibliomic Data. BioMed Research International No. 2016 (2016), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1098871
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Kawasaki, Regiane& Baraúna, Rafael A.& Silva, Artur& Carepo, Marta S. P.& Oliveira, Rui& Marques, Rodolfo…[et al.]. Reconstruction of the Fatty Acid Biosynthetic Pathway of Exiguobacterium antarcticum B7 Based on Genomic and Bibliomic Data. BioMed Research International. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1098871
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1098871
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)