A Shortest Dependency Path Based Convolutional Neural Network for Protein-Protein Relation Extraction
المؤلفون المشاركون
المصدر
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-07-14
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
The state-of-the-art methods for protein-protein interaction (PPI) extraction are primarily based on kernel methods, and their performances strongly depend on the handcraft features.
In this paper, we tackle PPI extraction by using convolutional neural networks (CNN) and propose a shortest dependency path based CNN (sdpCNN) model.
The proposed method ( 1 ) only takes the sdp and word embedding as input and ( 2 ) could avoid bias from feature selection by using CNN.
We performed experiments on standard Aimed and BioInfer datasets, and the experimental results demonstrated that our approach outperformed state-of-the-art kernel based methods.
In particular, by tracking the sdpCNN model, we find that sdpCNN could extract key features automatically and it is verified that pretrained word embedding is crucial in PPI task.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Hua, Lei& Quan, Chanqin. 2016. A Shortest Dependency Path Based Convolutional Neural Network for Protein-Protein Relation Extraction. BioMed Research International،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1099067
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Hua, Lei& Quan, Chanqin. A Shortest Dependency Path Based Convolutional Neural Network for Protein-Protein Relation Extraction. BioMed Research International No. 2016 (2016), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1099067
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Hua, Lei& Quan, Chanqin. A Shortest Dependency Path Based Convolutional Neural Network for Protein-Protein Relation Extraction. BioMed Research International. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1099067
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1099067
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر