Diverse Molecular Genotypes of Mycobacterium tuberculosis Complex Isolates Circulating in the Free State, South Africa
المؤلفون المشاركون
Van der Spoel van Dijk, Anneke
Makhoahle, Pakiso M.
Baba, Kamaldeen
Rigouts, Leen
المصدر
International Journal of Microbiology
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-7، 7ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-03-17
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
7
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Tuberculosis is a serious public health concern especially in Africa and Asia.
Studies describing strain diversity are lacking in the Free State region of South Africa.
The aim of the study was to describe the diversity of Mycobacterium tuberculosis (M.
tuberculosis) strain families in the Free State province of South Africa.
A total of 86 M.
tuberculosis isolates were genotyped using spoligotyping.
A 12-locus mycobacterial interspersed repetitive units-variable-number tandem repeats (MIRU-VNTRs) typing was used to further characterize the resulting spoligotyping clusters.
SITVITWEB identified 49 different patterns with allocation to six lineages including Latin-American-Mediterranean (LAM) (18 isolates), T (14 isolates), Beijing (five isolates), S (six isolates), Haarlem (one isolate), and X (five isolates), while 37 (43.0%) orphans were identified.
Eight clusters included 37 isolates with identical spoligotypes (2 to 13/cluster).
MIRU-VNTR typing further differentiated three spoligotyping clusters: SIT1/Beijing/MIT17, SIT33/LAM3/MIT213, and confirmed one SIT34/S/MIT311.
In addition, SpolDB3/RIM assignment of the orphan strains resulted in a further 10 LAM and 13 T families.
In total, LAM (28 isolates) and T (27 isolates) cause 63% of the individual cases of MTB in our study.
The Free State has a highly diverse TB population with LAM being predominant.
Further studies with inclusion of multidrug-resistant strains with larger sample size are warranted.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Van der Spoel van Dijk, Anneke& Makhoahle, Pakiso M.& Rigouts, Leen& Baba, Kamaldeen. 2016. Diverse Molecular Genotypes of Mycobacterium tuberculosis Complex Isolates Circulating in the Free State, South Africa. International Journal of Microbiology،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1106280
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Van der Spoel van Dijk, Anneke…[et al.]. Diverse Molecular Genotypes of Mycobacterium tuberculosis Complex Isolates Circulating in the Free State, South Africa. International Journal of Microbiology No. 2016 (2016), pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1106280
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Van der Spoel van Dijk, Anneke& Makhoahle, Pakiso M.& Rigouts, Leen& Baba, Kamaldeen. Diverse Molecular Genotypes of Mycobacterium tuberculosis Complex Isolates Circulating in the Free State, South Africa. International Journal of Microbiology. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1106280
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1106280
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر