Prediction of G Protein-Coupled Receptors with SVM-Prot Features and Random Forest
المؤلفون المشاركون
المصدر
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-07-27
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
G protein-coupled receptors (GPCRs) are the largest receptor superfamily.
In this paper, we try to employ physical-chemical properties, which come from SVM-Prot, to represent GPCR.
Random Forest was utilized as classifier for distinguishing them from other protein sequences.
MEME suite was used to detect the most significant 10 conserved motifs of human GPCRs.
In the testing datasets, the average accuracy was 91.61%, and the average AUC was 0.9282.
MEME discovery analysis showed that many motifs aggregated in the seven hydrophobic helices transmembrane regions adapt to the characteristic of GPCRs.
All of the above indicate that our machine-learning method can successfully distinguish GPCRs from non-GPCRs.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Liao, Zhijun& Ju, Ying& Zou, Quan. 2016. Prediction of G Protein-Coupled Receptors with SVM-Prot Features and Random Forest. Scientifica،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1117911
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Liao, Zhijun…[et al.]. Prediction of G Protein-Coupled Receptors with SVM-Prot Features and Random Forest. Scientifica No. 2016 (2016), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1117911
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Liao, Zhijun& Ju, Ying& Zou, Quan. Prediction of G Protein-Coupled Receptors with SVM-Prot Features and Random Forest. Scientifica. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1117911
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1117911
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر