Disease Sequences High-Accuracy Alignment Based on the Precision Medicine
المؤلفون المشاركون
Shen, Youjian
Li, ManZhi
Long, HaiXia
Wang, HongTao
Fu, HaiYan
Xu, Dong
Liao, Bo
Yao, Yuhua
المصدر
العدد
المجلد 2018، العدد 2018 (31 ديسمبر/كانون الأول 2018)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2018-02-22
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
High-accuracy alignment of sequences with disease information contributes to disease treatment and prevention.
The results of multiple sequence alignment depend on the parameters of the objective function, including gap open penalties (GOP), gap extension penalties (GEP), and substitution matrix (SM).
Firstly, the theory parameter formulas relating to GOP, GAP, and SM are inferred, combining unaligned sequence length, number, and identity.
Secondly, we tested the rationality of the theory parameter formulas, with experiment on the ClustalW and MAFFT program.
In addition, we obtained a group of MAFFT program parameters according to the formulas proposed.
The results of all experiments show that the SPS (sum-of-pair score) obtained from theory parameters is better than the SPS obtained from the default parameters of ClustalW and MAFFT.
In both theory and practice, our method to determine the parameters is feasible and efficient.
These can provide high-accuracy alignment results for precision medicine.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Li, ManZhi& Long, HaiXia& Wang, HongTao& Fu, HaiYan& Xu, Dong& Shen, Youjian…[et al.]. 2018. Disease Sequences High-Accuracy Alignment Based on the Precision Medicine. BioMed Research International،Vol. 2018, no. 2018, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1124598
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Li, ManZhi…[et al.]. Disease Sequences High-Accuracy Alignment Based on the Precision Medicine. BioMed Research International No. 2018 (2018), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1124598
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Li, ManZhi& Long, HaiXia& Wang, HongTao& Fu, HaiYan& Xu, Dong& Shen, Youjian…[et al.]. Disease Sequences High-Accuracy Alignment Based on the Precision Medicine. BioMed Research International. 2018. Vol. 2018, no. 2018, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1124598
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1124598
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر