An Approach to Identify Individual Functional Single Nucleotide Polymorphisms and Isoform MicroRNAs
المؤلفون المشاركون
Wang, Ying
Ru, Jidong
Jin, Tao
Sun, Ming
Jia, Lizhu
Sun, Guijiang
المصدر
العدد
المجلد 2019، العدد 2019 (31 ديسمبر/كانون الأول 2019)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2019-07-30
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
MicroRNAs (miRNAs) and single nucleotide polymorphisms (SNPs) play important roles in disease risk and development, especially cancer.
Importantly, when SNPs are located in pre-miRNAs, they affect their splicing mechanism and change the function of miRNAs.
To improve disease risk assessment, we propose an approach and developed a software tool, IsomiR_Find, to identify disease/phenotype-related SNPs and isomiRs in individuals.
Our approach is based on the individual’s samples, with SNP information extracted from the 1000 Genomes Project.
SNPs were mapped to pre-miRNAs based on whole-genome coordinates and then SNP-pre-miRNA sequences were constructed.
Moreover, we developed matpred2, a software tool to identify the four splicing sites of mature miRNAs.
Using matpred2, we identified isomiRs and then verified them by searching within individual miRNA sequencing data.
Our approach yielded biomarkers for biological experiments, mined functions of miRNAs and SNPs, improved disease risk assessment, and provided a way to achieve individualized precision medicine.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Wang, Ying & Ru, Jidong& Jin, Tao& Sun, Ming& Jia, Lizhu& Sun, Guijiang. 2019. An Approach to Identify Individual Functional Single Nucleotide Polymorphisms and Isoform MicroRNAs. BioMed Research International،Vol. 2019, no. 2019, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1126531
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Wang, Ying…[et al.]. An Approach to Identify Individual Functional Single Nucleotide Polymorphisms and Isoform MicroRNAs. BioMed Research International No. 2019 (2019), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1126531
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Wang, Ying & Ru, Jidong& Jin, Tao& Sun, Ming& Jia, Lizhu& Sun, Guijiang. An Approach to Identify Individual Functional Single Nucleotide Polymorphisms and Isoform MicroRNAs. BioMed Research International. 2019. Vol. 2019, no. 2019, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1126531
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1126531
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر