Alternative Polyadenylation Modification Patterns Reveal Essential Posttranscription Regulatory Mechanisms of Tumorigenesis in Multiple Tumor Types
المؤلفون المشاركون
Feng, Kaiyan
Huang, Tao
Zhang, Yu-Hang
Zeng, Tao
Li, Min
Pan, XiaoYong
Chen, Lei
Cai, Yu-Dong
المصدر
العدد
المجلد 2020، العدد 2020 (31 ديسمبر/كانون الأول 2020)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2020-06-16
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Among various risk factors for the initiation and progression of cancer, alternative polyadenylation (APA) is a remarkable endogenous contributor that directly triggers the malignant phenotype of cancer cells.
APA affects biological processes at a transcriptional level in various ways.
As such, APA can be involved in tumorigenesis through gene expression, protein subcellular localization, or transcription splicing pattern.
The APA sites and status of different cancer types may have diverse modification patterns and regulatory mechanisms on transcripts.
Potential APA sites were screened by applying several machine learning algorithms on a TCGA-APA dataset.
First, a powerful feature selection method, minimum redundancy maximum relevancy, was applied on the dataset, resulting in a feature list.
Then, the feature list was fed into the incremental feature selection, which incorporated the support vector machine as the classification algorithm, to extract key APA features and build a classifier.
The classifier can classify cancer patients into cancer types with perfect performance.
The key APA-modified genes had a potential prognosis ability because of their significant power in the survival analysis of TCGA pan-cancer data.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Li, Min& Pan, XiaoYong& Zeng, Tao& Zhang, Yu-Hang& Feng, Kaiyan& Chen, Lei…[et al.]. 2020. Alternative Polyadenylation Modification Patterns Reveal Essential Posttranscription Regulatory Mechanisms of Tumorigenesis in Multiple Tumor Types. BioMed Research International،Vol. 2020, no. 2020, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1135804
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Li, Min…[et al.]. Alternative Polyadenylation Modification Patterns Reveal Essential Posttranscription Regulatory Mechanisms of Tumorigenesis in Multiple Tumor Types. BioMed Research International No. 2020 (2020), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1135804
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Li, Min& Pan, XiaoYong& Zeng, Tao& Zhang, Yu-Hang& Feng, Kaiyan& Chen, Lei…[et al.]. Alternative Polyadenylation Modification Patterns Reveal Essential Posttranscription Regulatory Mechanisms of Tumorigenesis in Multiple Tumor Types. BioMed Research International. 2020. Vol. 2020, no. 2020, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1135804
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1135804
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر