HMMBinder: DNA-Binding Protein Prediction Using HMM Profile Based Features
المؤلفون المشاركون
Rashid, Mahmood A.
Zaman, Rianon
Chowdhury, Shahana Yasmin
Sharma, Alok
Dehzangi, Abdollah
Shatabda, Swakkhar
المصدر
العدد
المجلد 2017، العدد 2017 (31 ديسمبر/كانون الأول 2017)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2017-11-14
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
DNA-binding proteins often play important role in various processes within the cell.
Over the last decade, a wide range of classification algorithms and feature extraction techniques have been used to solve this problem.
In this paper, we propose a novel DNA-binding protein prediction method called HMMBinder.
HMMBinder uses monogram and bigram features extracted from the HMM profiles of the protein sequences.
To the best of our knowledge, this is the first application of HMM profile based features for the DNA-binding protein prediction problem.
We applied Support Vector Machines (SVM) as a classification technique in HMMBinder.
Our method was tested on standard benchmark datasets.
We experimentally show that our method outperforms the state-of-the-art methods found in the literature.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Zaman, Rianon& Chowdhury, Shahana Yasmin& Rashid, Mahmood A.& Sharma, Alok& Dehzangi, Abdollah& Shatabda, Swakkhar. 2017. HMMBinder: DNA-Binding Protein Prediction Using HMM Profile Based Features. BioMed Research International،Vol. 2017, no. 2017, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137155
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Zaman, Rianon…[et al.]. HMMBinder: DNA-Binding Protein Prediction Using HMM Profile Based Features. BioMed Research International No. 2017 (2017), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137155
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Zaman, Rianon& Chowdhury, Shahana Yasmin& Rashid, Mahmood A.& Sharma, Alok& Dehzangi, Abdollah& Shatabda, Swakkhar. HMMBinder: DNA-Binding Protein Prediction Using HMM Profile Based Features. BioMed Research International. 2017. Vol. 2017, no. 2017, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137155
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1137155
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر