Systematic Identification and Molecular Characteristics of Long Noncoding RNAs in Pig Tissues
المؤلفون المشاركون
Li, Kui
Yang, Yalan
Zhou, Rong
Zhu, Shiyun
Li, Xunbi
Li, Hua
Yu, Hui
المصدر
العدد
المجلد 2017، العدد 2017 (31 ديسمبر/كانون الأول 2017)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2017-09-14
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Long noncoding RNAs (lncRNAs) are non-protein-coding RNAs that are involved in a variety of biological processes.
The pig is an important farm animal and an ideal biomedical model.
In this study, we performed a genome-wide scan for lncRNAs in multiple tissue types from pigs.
A total of 118 million paired-end 90 nt clean reads were obtained via strand-specific RNA sequencing, 80.4% of which were aligned to the pig reference genome.
We developed a stringent bioinformatics pipeline to identify 2,139 high-quality multiexonic lncRNAs.
The characteristic analysis revealed that the novel lncRNAs showed relatively shorter transcript length, fewer exons, and lower expression levels in comparison with protein-coding genes (PCGs).
The guanine-cytosine (GC) content of the protein-coding exons and introns was significantly higher than that of the lncRNAs.
Moreover, the single nucleotide polymorphism (SNP) density of lncRNAs was significantly higher than that of PCGs.
Conservation analysis revealed that most lncRNAs were evolutionarily conserved among pigs, humans, and mice, such as CUFF.253988.1, which shares homology with human long noncoding RNA MALAT1.
The findings of our study significantly increase the number of known lncRNAs in pigs.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Yang, Yalan& Zhou, Rong& Zhu, Shiyun& Li, Xunbi& Li, Hua& Yu, Hui…[et al.]. 2017. Systematic Identification and Molecular Characteristics of Long Noncoding RNAs in Pig Tissues. BioMed Research International،Vol. 2017, no. 2017, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137976
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Yang, Yalan…[et al.]. Systematic Identification and Molecular Characteristics of Long Noncoding RNAs in Pig Tissues. BioMed Research International No. 2017 (2017), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137976
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Yang, Yalan& Zhou, Rong& Zhu, Shiyun& Li, Xunbi& Li, Hua& Yu, Hui…[et al.]. Systematic Identification and Molecular Characteristics of Long Noncoding RNAs in Pig Tissues. BioMed Research International. 2017. Vol. 2017, no. 2017, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137976
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1137976
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر