Topological Characterization of Human and Mouse m5C Epitranscriptome Revealed by Bisulfite Sequencing
المؤلفون المشاركون
Huang, Yufei
Meng, Jia
Wei, Zhen
Magalhães, João Pedro de
Rong, Rong
Lu, Zhiliang
Panneerdoss, Subbarayalu
Timilsina, Santosh
Zhu, Jingting
Mohammad, Tabrez A.
Rao, Manjeet K.
Chen, Yidong
المصدر
International Journal of Genomics
العدد
المجلد 2018، العدد 2018 (31 ديسمبر/كانون الأول 2018)، ص ص. 1-19، 19ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2018-06-13
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
19
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Background.
Compared with the well-studied 5-methylcytosine (m5C) in DNA, the role and topology of epitranscriptome m5C remain insufficiently characterized.
Results.
Through analyzing transcriptome-wide m5C distribution in human and mouse, we show that the m5C modification is significantly enriched at 5′ untranslated regions (5′UTRs) of mRNA in human and mouse.
With a comparative analysis of the mRNA and DNA methylome, we demonstrate that, like DNA methylation, transcriptome m5C methylation exhibits a strong clustering effect.
Surprisingly, an inverse correlation between mRNA and DNA m5C methylation is observed at CpG sites.
Further analysis reveals that RNA m5C methylation level is positively correlated with both RNA expression and RNA half-life.
We also observed that the methylation level of mitochondrial RNAs is significantly higher than RNAs transcribed from the nuclear genome.
Conclusions.
This study provides an in-depth topological characterization of transcriptome-wide m5C modification by associating RNA m5C methylation patterns with transcriptional expression, DNA methylations, RNA stabilities, and mitochondrial genome.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Wei, Zhen& Panneerdoss, Subbarayalu& Timilsina, Santosh& Zhu, Jingting& Mohammad, Tabrez A.& Lu, Zhiliang…[et al.]. 2018. Topological Characterization of Human and Mouse m5C Epitranscriptome Revealed by Bisulfite Sequencing. International Journal of Genomics،Vol. 2018, no. 2018, pp.1-19.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1172669
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Wei, Zhen…[et al.]. Topological Characterization of Human and Mouse m5C Epitranscriptome Revealed by Bisulfite Sequencing. International Journal of Genomics No. 2018 (2018), pp.1-19.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1172669
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Wei, Zhen& Panneerdoss, Subbarayalu& Timilsina, Santosh& Zhu, Jingting& Mohammad, Tabrez A.& Lu, Zhiliang…[et al.]. Topological Characterization of Human and Mouse m5C Epitranscriptome Revealed by Bisulfite Sequencing. International Journal of Genomics. 2018. Vol. 2018, no. 2018, pp.1-19.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1172669
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1172669
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر