Molecular adaptive evolution of SARS-COV-2 spike protein in Saudi Arabia
المؤلفون المشاركون
Hanif, Atif
Ifan, Salih A.
Nur, Islam
al-Anzi, Ibrahim Uqlah
المصدر
Saudi Journal of Biological Sciences
العدد
المجلد 28، العدد 6 (30 يونيو/حزيران 2021)، ص ص. 3325-3332، 8ص.
الناشر
تاريخ النشر
2021-06-30
دولة النشر
السعودية
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
The sequences of SARS-CoV-2 spike (S) from Saudi Arabia along with SARS-CoV and bat SARS-like CoVs were obtained.
Positive selection analysis and secondary structure investigation of spike sequences were performed.
adaptive molecular evolution was observed in SARS-CoV-2 displayed by positive selection pressure at n-terminal domain (NTD; codons 41, 163, 174 and 218), receptor binding domain (RBD; codons 378 and 404) and S1/S2 Cleavage site (codon 690).
furthermore, the spike protein secondary structure depicted by the homo-trimer structure showed a high similarity between Saudi SARS-CoV-2 isolate and the parental strain (bat SL-COVZC45).
Despite the high similarity depicted in the spike sequence model alignment, it displayed a significant difference when each chain was treated solely owing to 7 motif differences in the three composing chains.
in addition, SARS-CoV-2 S trimer model uncovered the presence of n-acetyl glucosamine ligands.
eventually, 3C-like proteinase cleavage site was observed in s2 domain could be used as a site for drug discovery.
genetics and molecular evolutionary facts are useful for assessment of evolution, host adaptation and epidemic patterns ultimately helpful for adaptation of control strategies.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Nur, Islam& al-Anzi, Ibrahim Uqlah& Hanif, Atif& Ifan, Salih A.. 2021. Molecular adaptive evolution of SARS-COV-2 spike protein in Saudi Arabia. Saudi Journal of Biological Sciences،Vol. 28, no. 6, pp.3325-3332.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1410834
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
al-Anzi, Ibrahim Uqlah…[et al.]. Molecular adaptive evolution of SARS-COV-2 spike protein in Saudi Arabia. Saudi Journal of Biological Sciences Vol. 28, no. 6 (2021), pp.3325-3332.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1410834
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Nur, Islam& al-Anzi, Ibrahim Uqlah& Hanif, Atif& Ifan, Salih A.. Molecular adaptive evolution of SARS-COV-2 spike protein in Saudi Arabia. Saudi Journal of Biological Sciences. 2021. Vol. 28, no. 6, pp.3325-3332.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1410834
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references : p. 3332
رقم السجل
BIM-1410834
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر