DNA sequence matching utilizing exact and in-exact string matching with look-up table
مقدم أطروحة جامعية
مشرف أطروحة جامعية
al-Khalidi, Jihad O.
Adwan, Sahar
أعضاء اللجنة
Shatnawi, Umar Ali
Ababinah, Muhammad Husayn Salim
Bani Muhammad, Sad
الجامعة
جامعة آل البيت
الكلية
كلية الأمير الحسين بن عبد الله لتكنولوجيا المعلومات
القسم الأكاديمي
قسم علوم الحاسوب
دولة الجامعة
الأردن
الدرجة العلمية
ماجستير
تاريخ الدرجة العلمية
2013
الملخص الإنجليزي
In Bioinformatics a sequence alignment is a way of arranging the sequences of DNA (Deoxyribonucleic Acid), RNA (Ribonucleic Acid), or protein to identify regions of similarity that maybe a consequence of functional, structural or evolutionary relationship between sequences In this thesis we present an algorithm that uses exact and inexact matching based on indexed local pair wise alignment of the DNA sequences.
The proposed algorithm is inspired from the well-known FASTA (fast-All) algorithm which is one of the main approximate string matching algorithms The experimental results have shown that the proposed algorithm performs better than FASTA algorithm in most of the cases.
التخصصات الرئيسية
الموضوعات
عدد الصفحات
44
قائمة المحتويات
Table of contents.
Abstract.
Chapter One : introduction.
Chapter Two : bioinformatics and string matching.
Chapter Three : literature review.
Chapter Four : the proposed algorithm.
Chapter Five : system design and implementation.
Chapter Six : experimental results.
Chapter Seven : conclusion and future works.
References.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Assaf, Suzan Assaf Salih. (2013). DNA sequence matching utilizing exact and in-exact string matching with look-up table. (Master's theses Theses and Dissertations Master). Al albayt University, Jordan
https://search.emarefa.net/detail/BIM-321714
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Assaf, Suzan Assaf Salih. DNA sequence matching utilizing exact and in-exact string matching with look-up table. (Master's theses Theses and Dissertations Master). Al albayt University. (2013).
https://search.emarefa.net/detail/BIM-321714
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Assaf, Suzan Assaf Salih. (2013). DNA sequence matching utilizing exact and in-exact string matching with look-up table. (Master's theses Theses and Dissertations Master). Al albayt University, Jordan
https://search.emarefa.net/detail/BIM-321714
لغة النص
الإنجليزية
نوع البيانات
رسائل جامعية
رقم السجل
BIM-321714
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر