DNA sequence matching utilizing exact and in-exact string matching with look-up table

الجامعة

جامعة آل البيت

الكلية

كلية الأمير الحسين بن عبد الله لتكنولوجيا المعلومات

القسم الأكاديمي

قسم علوم الحاسوب

دولة الجامعة

الأردن

الدرجة العلمية

ماجستير

تاريخ الدرجة العلمية

2013

الملخص الإنجليزي

In Bioinformatics a sequence alignment is a way of arranging the sequences of DNA (Deoxyribonucleic Acid), RNA (Ribonucleic Acid), or protein to identify regions of similarity that maybe a consequence of functional, structural or evolutionary relationship between sequences In this thesis we present an algorithm that uses exact and inexact matching based on indexed local pair wise alignment of the DNA sequences.

The proposed algorithm is inspired from the well-known FASTA (fast-All) algorithm which is one of the main approximate string matching algorithms The experimental results have shown that the proposed algorithm performs better than FASTA algorithm in most of the cases.

التخصصات الرئيسية

الأحياء

الموضوعات

تسلسل الأحماض الأمينية

عدد الصفحات

قائمة المحتويات

Table of contents.

Abstract.

Chapter One : introduction.

Chapter Two : bioinformatics and string matching.

Chapter Three : literature review.

Chapter Four : the proposed algorithm.

Chapter Five : system design and implementation.

Chapter Six : experimental results.

Chapter Seven : conclusion and future works.

References.

نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)

Assaf, Suzan Assaf Salih. (2013). DNA sequence matching utilizing exact and in-exact string matching with look-up table. (Master's theses Theses and Dissertations Master). Al albayt University, Jordan
https://search.emarefa.net/detail/BIM-321714

نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)

Assaf, Suzan Assaf Salih. DNA sequence matching utilizing exact and in-exact string matching with look-up table. (Master's theses Theses and Dissertations Master). Al albayt University. (2013).
https://search.emarefa.net/detail/BIM-321714

نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)

لغة النص

الإنجليزية

نوع البيانات

رسائل جامعية

رقم السجل

BIM-321714

حفظتم الحفظ طباعة

قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"

أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي

مرصد "معرفة"
لقياس الإنتاج العلمي العربي

تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر