Comparisons of direct extraction methods of microbial DNA from different paddy soils
المؤلفون المشاركون
Islam, Rashidul
Sultanah, Tahirah
Joe, M. Melvin
Cho, Jang Cheon
Sa, Tongmin
المصدر
Saudi Journal of Biological Sciences
العدد
المجلد 19، العدد 3 (30 سبتمبر/أيلول 2012)، ص ص. 337-342، 6ص.
الناشر
تاريخ النشر
2012-09-30
دولة النشر
السعودية
عدد الصفحات
6
التخصصات الرئيسية
الموضوعات
الملخص EN
Molecular analyses for the study of soil microbial communities often depend on the direct extraction of DNA from soils.
The present work compares the effectiveness of three different methods of extracting microbial DNA from seven different paddy soils.
Comparison among different DNA extraction methods against different paddy soil samples revealed a marked variation in DNA yields from 3.18–20.17 lg DNA/g of dry soil.
However, irrespective of the soil samples and extraction methods the DNA fragment size was >10 kb.
Among the methods evaluated, method-C (chemical–enzymatic–mechanical) had better cell lysis efficiency and DNA yield.
After purification of crude DNA by Purification Kit, A260/A230 and A260/ A280 ratios of the DNA obtained by method-C reached up to 2.27 and 1.89, respectively, sustaining the efficacy of this technique in removing humic acid, protein and other contaminants.
Results of the comprehensive evaluation of DNA extraction methods suggest that method-C is superior to other two methods (chemical–enzymatic and chemical– mechanical), and was the best choice for extraction of total DNA from soil samples.
Since soil type and microbial community characteristics influence DNA recovery, this study provides
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Islam, Rashidul& Sultanah, Tahirah& Joe, M. Melvin& Cho, Jang Cheon& Sa, Tongmin. 2012. Comparisons of direct extraction methods of microbial DNA from different paddy soils. Saudi Journal of Biological Sciences،Vol. 19, no. 3, pp.337-342.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-359474
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Islam, Rashidul…[et al.]. Comparisons of direct extraction methods of microbial DNA from different paddy soils. Saudi Journal of Biological Sciences Vol. 19, no. 3 (2012), pp.337-342.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-359474
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Islam, Rashidul& Sultanah, Tahirah& Joe, M. Melvin& Cho, Jang Cheon& Sa, Tongmin. Comparisons of direct extraction methods of microbial DNA from different paddy soils. Saudi Journal of Biological Sciences. 2012. Vol. 19, no. 3, pp.337-342.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-359474
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references : p. 341-342
رقم السجل
BIM-359474
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر