High Potential Source for Biomass Degradation Enzyme Discovery and Environmental Aspects Revealed through Metagenomics of Indian Buffalo Rumen
المؤلفون المشاركون
Joshi, C. G.
Singh, K. M.
Patel, J. B.
Reddy, Bhaskar
Patel, A. K.
Parmar, Nidhi
Patel, Dishita
Patel, Anand
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-07-17
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
The complex microbiomes of the rumen functions as an effective system for plant cell wall degradation, and biomass utilization provide genetic resource for degrading microbial enzymes that could be used in the production of biofuel.
Therefore the buffalo rumen microbiota was surveyed using shot gun sequencing.
This metagenomic sequencing generated 3.9 GB of sequences and data were assembled into 137270 contiguous sequences (contigs).
We identified potential 2614 contigs encoding biomass degrading enzymes including glycoside hydrolases (GH: 1943 contigs), carbohydrate binding module (CBM: 23 contigs), glycosyl transferase (GT: 373 contigs), carbohydrate esterases (CE: 259 contigs), and polysaccharide lyases (PE: 16 contigs).
The hierarchical clustering of buffalo metagenomes demonstrated the similarities and dissimilarity in microbial community structures and functional capacity.
This demonstrates that buffalo rumen microbiome was considerably enriched in functional genes involved in polysaccharide degradation with great prospects to obtain new molecules that may be applied in the biofuel industry.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Singh, K. M.& Reddy, Bhaskar& Patel, Dishita& Patel, A. K.& Parmar, Nidhi& Patel, Anand…[et al.]. 2014. High Potential Source for Biomass Degradation Enzyme Discovery and Environmental Aspects Revealed through Metagenomics of Indian Buffalo Rumen. BioMed Research International،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-458801
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Singh, K. M.…[et al.]. High Potential Source for Biomass Degradation Enzyme Discovery and Environmental Aspects Revealed through Metagenomics of Indian Buffalo Rumen. BioMed Research International No. 2014 (2014), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-458801
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Singh, K. M.& Reddy, Bhaskar& Patel, Dishita& Patel, A. K.& Parmar, Nidhi& Patel, Anand…[et al.]. High Potential Source for Biomass Degradation Enzyme Discovery and Environmental Aspects Revealed through Metagenomics of Indian Buffalo Rumen. BioMed Research International. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-458801
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-458801
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر