Prediction of Carbohydrate-Binding Proteins from Sequences Using Support Vector Machines
المؤلفون المشاركون
Sumikoshi, Kazuya
Terada, Tohru
Nakamura, Shugo
Cao, Wei
Hirose, Osamu
Ge, Zhenyi
Someya, Seizi
Shimizu, Kentaro
Morita, Mizuki
Kakuta, Masanori
المصدر
العدد
المجلد 2010، العدد 2010 (31 ديسمبر/كانون الأول 2010)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2010-09-27
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الأحياء
الملخص EN
Carbohydrate-binding proteins are proteins that can interact with sugar chains but do not modify them.
They are involved in many physiological functions, and we have developed a method for predicting them from their amino acid sequences.
Our method is based on support vector machines (SVMs).
We first clarified the definition of carbohydrate-binding proteins and then constructed positive and negative datasets with which the SVMs were trained.
By applying the leave-one-out test to these datasets, our method delivered 0.92 of the area under the receiver operating characteristic (ROC) curve.
We also examined two amino acid grouping methods that enable effective learning of sequence patterns and evaluated the performance of these methods.
When we applied our method in combination with the homology-based prediction method to the annotated human genome database, H-invDB, we found that the true positive rate of prediction was improved.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Someya, Seizi& Kakuta, Masanori& Morita, Mizuki& Sumikoshi, Kazuya& Cao, Wei& Ge, Zhenyi…[et al.]. 2010. Prediction of Carbohydrate-Binding Proteins from Sequences Using Support Vector Machines. Advances in Bioinformatics،Vol. 2010, no. 2010, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-460640
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Someya, Seizi…[et al.]. Prediction of Carbohydrate-Binding Proteins from Sequences Using Support Vector Machines. Advances in Bioinformatics No. 2010 (2010), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-460640
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Someya, Seizi& Kakuta, Masanori& Morita, Mizuki& Sumikoshi, Kazuya& Cao, Wei& Ge, Zhenyi…[et al.]. Prediction of Carbohydrate-Binding Proteins from Sequences Using Support Vector Machines. Advances in Bioinformatics. 2010. Vol. 2010, no. 2010, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-460640
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-460640
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر