Modeling and Visualizing Cell Type Switching
المؤلفون المشاركون
Flann, Nicholas S.
Ghaffarizadeh, Ahmadreza
Podgorski, Gregory J.
المصدر
Computational and Mathematical Methods in Medicine
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-04-14
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Understanding cellular differentiation is critical in explaining development and for taming diseases such as cancer.
Differentiation is conventionally represented using bifurcating lineage trees.
However, these lineage trees cannot readily capture or quantify all the types of transitions now known to occur between cell types, including transdifferentiation or differentiation off standard paths.
This work introduces a new analysis and visualization technique that is capable of representing all possible transitions between cell states compactly, quantitatively, and intuitively.
This method considers the regulatory network of transcription factors that control cell type determination and then performs an analysis of network dynamics to identify stable expression profiles and the potential cell types that they represent.
A visualization tool called CellDiff3D creates an intuitive three-dimensional graph that shows the overall direction and probability of transitions between all pairs of cell types within a lineage.
In this study, the influence of gene expression noise and mutational changes during myeloid cell differentiation are presented as a demonstration of the CellDiff3D technique, a new approach to quantify and envision all possible cell state transitions in any lineage network.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Ghaffarizadeh, Ahmadreza& Podgorski, Gregory J.& Flann, Nicholas S.. 2014. Modeling and Visualizing Cell Type Switching. Computational and Mathematical Methods in Medicine،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-461097
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Ghaffarizadeh, Ahmadreza…[et al.]. Modeling and Visualizing Cell Type Switching. Computational and Mathematical Methods in Medicine No. 2014 (2014), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-461097
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Ghaffarizadeh, Ahmadreza& Podgorski, Gregory J.& Flann, Nicholas S.. Modeling and Visualizing Cell Type Switching. Computational and Mathematical Methods in Medicine. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-461097
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-461097
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر