Integrative Genomics with Mediation Analysis in a Survival Context
المؤلفون المشاركون
Danielsson, Anna
Helou, Khalil
Einbeigi, Zakaria
Nemes, Szilárd
Parris, Toshima Z.
Jonasson, Junmei Miao
Steineck, Gunnar
المصدر
Computational and Mathematical Methods in Medicine
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-12-18
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
DNA copy number aberrations (DCNA) and subsequent altered gene expression profiles may have a major impact on tumor initiation, on development, and eventually on recurrence and cancer-specific mortality.
However, most methods employed in integrative genomic analysis of the two biological levels, DNA and RNA, do not consider survival time.
In the present note, we propose the adoption of a survival analysis-based framework for the integrative analysis of DCNA and mRNA levels to reveal their implication on patient clinical outcome with the prerequisite that the effect of DCNA on survival is mediated by mRNA levels.
The specific aim of the paper is to offer a feasible framework to test the DCNA-mRNA-survival pathway.
We provide statistical inference algorithms for mediation based on asymptotic results.
Furthermore, we illustrate the applicability of the method in an integrative genomic analysis setting by using a breast cancer data set consisting of 141 invasive breast tumors.
In addition, we provide implementation in R.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Nemes, Szilárd& Parris, Toshima Z.& Danielsson, Anna& Einbeigi, Zakaria& Steineck, Gunnar& Jonasson, Junmei Miao…[et al.]. 2013. Integrative Genomics with Mediation Analysis in a Survival Context. Computational and Mathematical Methods in Medicine،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-470206
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Nemes, Szilárd…[et al.]. Integrative Genomics with Mediation Analysis in a Survival Context. Computational and Mathematical Methods in Medicine No. 2013 (2013), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-470206
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Nemes, Szilárd& Parris, Toshima Z.& Danielsson, Anna& Einbeigi, Zakaria& Steineck, Gunnar& Jonasson, Junmei Miao…[et al.]. Integrative Genomics with Mediation Analysis in a Survival Context. Computational and Mathematical Methods in Medicine. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-470206
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-470206
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر