![](/images/graphics-bg.png)
PolyAlign : A Versatile LC-MS Data Alignment Tool for Landmark-Selected and -Automated Use
المؤلفون المشاركون
Salmi, Jussi
Moulder, Robert
Aittokallio, Tero
Lahesmaa, Riitta
Vähämaa, Heidi
Hosia, Waltteri
Koskinen, Ville R.
Nevalainen, Olli S.
المصدر
International Journal of Proteomics
العدد
المجلد 2011، العدد 2011 (31 ديسمبر/كانون الأول 2011)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2011-04-19
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الأحياء
الملخص EN
We present a versatile user-friendly software tool, PolyAlign, for the alignment of multiple LC-MS signal maps with the option of manual landmark setting or automated alignment.
One of the spectral images is selected as a reference map, and after manually setting the landmarks, the program warps the images using either polynomial or Hermite transformation.
The software provides an option for automated landmark finding.
The software includes a very fast zoom-in function synchronized between the images, which facilitate detecting correspondences between the adjacent images.
Such an interactive visual process enables the analyst to decide when the alignment is satisfactory and to correct known irregularities.
We demonstrate that the software provides significant improvements in the alignment of LC-MALDI data, with 10–15 landmark pairs, and it is also applicable to correcting electrospray LC-MS data.
The results with practical data show substantial improvement in peak alignment compared to MZmine, which was among the best analysis packages in a recent assessment.
The PolyAlign software is freely available and easily accessible as an integrated component of the popular MZmine software, and also as a simpler stand-alone Perl implementation to preview data and apply landmark directed polynomial transformation.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Vähämaa, Heidi& Koskinen, Ville R.& Hosia, Waltteri& Moulder, Robert& Nevalainen, Olli S.& Lahesmaa, Riitta…[et al.]. 2011. PolyAlign : A Versatile LC-MS Data Alignment Tool for Landmark-Selected and -Automated Use. International Journal of Proteomics،Vol. 2011, no. 2011, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-472521
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Vähämaa, Heidi…[et al.]. PolyAlign : A Versatile LC-MS Data Alignment Tool for Landmark-Selected and -Automated Use. International Journal of Proteomics No. 2011 (2011), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-472521
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Vähämaa, Heidi& Koskinen, Ville R.& Hosia, Waltteri& Moulder, Robert& Nevalainen, Olli S.& Lahesmaa, Riitta…[et al.]. PolyAlign : A Versatile LC-MS Data Alignment Tool for Landmark-Selected and -Automated Use. International Journal of Proteomics. 2011. Vol. 2011, no. 2011, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-472521
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-472521
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)