NOVOMIR : De Novo Prediction of MicroRNA-Coding Regions in a Single Plant-Genome
المؤلفون المشاركون
Teune, Jan-Hendrik
Steger, Gerhard
المصدر
العدد
المجلد 2010، العدد 2010 (31 ديسمبر/كانون الأول 2010)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2010-09-13
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
MicroRNAs (miRNA) are small regulatory, noncoding RNA molecules that are transcribed as primary miRNAs (pri-miRNA) from eukaryotic genomes.
At least in plants, their regulatory activity is mediated through base-pairing with protein-coding messenger RNAs (mRNA) followed by mRNA degradation or translation repression.
We describe NOVOMIR, a program for the identification of miRNA genes in plant genomes.
It uses a series of filter steps and a statistical model to discriminate a pre-miRNA from other RNAs and does rely neither on prior knowledge of a miRNA target nor on comparative genomics.
The sensitivity and specificity of NOVOMIR for detection of premiRNAs from Arabidopsis thaliana is ~0.83 and ~0.99, respectively.
Plant pre-miRNAs are more heterogeneous with respect to size and structure than animal pre-miRNAs.
Despite these difficulties, NOVOMIR is well suited to perform searches for pre-miRNAs on a genomic scale.
NOVOMIR is written in Perl and relies on two additional, free programs for prediction of RNA secondary structure (RNALFOLD, RNASHAPES).
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Teune, Jan-Hendrik& Steger, Gerhard. 2010. NOVOMIR : De Novo Prediction of MicroRNA-Coding Regions in a Single Plant-Genome. Journal of Nucleic Acids،Vol. 2010, no. 2010, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-476265
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Teune, Jan-Hendrik& Steger, Gerhard. NOVOMIR : De Novo Prediction of MicroRNA-Coding Regions in a Single Plant-Genome. Journal of Nucleic Acids No. 2010 (2010), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-476265
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Teune, Jan-Hendrik& Steger, Gerhard. NOVOMIR : De Novo Prediction of MicroRNA-Coding Regions in a Single Plant-Genome. Journal of Nucleic Acids. 2010. Vol. 2010, no. 2010, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-476265
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-476265
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر