![](/images/graphics-bg.png)
FSim : A Novel Functional Similarity Search Algorithm and Tool for Discovering Functionally Related Gene Products
المؤلفون المشاركون
Zhang, ZhengGuo
Hu, Qiang
Wang, ZhiGang
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-08-12
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Background.
During the analysis of genomics data, it is often required to quantify the functional similarity of genes and their products based on the annotation information from gene ontology (GO) with hierarchical structure.
A flexible and user-friendly way to estimate the functional similarity of genes utilizing GO annotation is therefore highly desired.
Results.
We proposed a novel algorithm using a level coefficient-weighted model to measure the functional similarity of gene products based on multiple ontologies of hierarchical GO annotations.
The performance of our algorithm was evaluated and found to be superior to the other tested methods.
We implemented the proposed algorithm in a software package, FSim, based on R statistical and computing environment.
It can be used to discover functionally related genes for a given gene, group of genes, or set of function terms.
Conclusions.
FSim is a flexible tool to analyze functional gene groups based on the GO annotation databases.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Hu, Qiang& Wang, ZhiGang& Zhang, ZhengGuo. 2014. FSim : A Novel Functional Similarity Search Algorithm and Tool for Discovering Functionally Related Gene Products. BioMed Research International،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-477286
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Hu, Qiang…[et al.]. FSim : A Novel Functional Similarity Search Algorithm and Tool for Discovering Functionally Related Gene Products. BioMed Research International No. 2014 (2014), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-477286
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Hu, Qiang& Wang, ZhiGang& Zhang, ZhengGuo. FSim : A Novel Functional Similarity Search Algorithm and Tool for Discovering Functionally Related Gene Products. BioMed Research International. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-477286
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-477286
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)