MRMPath and MRMutation, Facilitating Discovery of Mass Transitions for Proteotypic Peptides in Biological Pathways Using a Bioinformatics Approach
المؤلفون المشاركون
Crasto, Chiquito
Narne, Chandrahas
Wilson, Landon
Kawai, Mikako
Barnes, Stephen
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-01-29
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الأحياء
الملخص EN
Quantitative proteomics applications in mass spectrometry depend on the knowledge of the mass-to-charge ratio (m/z) values of proteotypic peptides for the proteins under study and their product ions.
MRMPath and MRMutation, web-based bioinformatics software that are platform independent, facilitate the recovery of this information by biologists.
MRMPath utilizes publicly available information related to biological pathways in the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) database.
All the proteins involved in pathways of interest are recovered and processed in silico to extract information relevant to quantitative mass spectrometry analysis.
Peptides may also be subjected to automated BLAST analysis to determine whether they are proteotypic.
MRMutation catalogs and makes available, following processing, known (mutant) variants of proteins from the current UniProtKB database.
All these results, available via the web from well-maintained, public databases, are written to an Excel spreadsheet, which the user can download and save.
MRMPath and MRMutation can be freely accessed.
As a system that seeks to allow two or more resources to interoperate, MRMPath represents an advance in bioinformatics tool development.
As a practical matter, the MRMPath automated approach represents significant time savings to researchers.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Crasto, Chiquito& Narne, Chandrahas& Kawai, Mikako& Wilson, Landon& Barnes, Stephen. 2013. MRMPath and MRMutation, Facilitating Discovery of Mass Transitions for Proteotypic Peptides in Biological Pathways Using a Bioinformatics Approach. Advances in Bioinformatics،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-478781
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Crasto, Chiquito…[et al.]. MRMPath and MRMutation, Facilitating Discovery of Mass Transitions for Proteotypic Peptides in Biological Pathways Using a Bioinformatics Approach. Advances in Bioinformatics No. 2013 (2013), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-478781
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Crasto, Chiquito& Narne, Chandrahas& Kawai, Mikako& Wilson, Landon& Barnes, Stephen. MRMPath and MRMutation, Facilitating Discovery of Mass Transitions for Proteotypic Peptides in Biological Pathways Using a Bioinformatics Approach. Advances in Bioinformatics. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-478781
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-478781
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر