![](/images/graphics-bg.png)
PPI Network Analysis of mRNA Expression Profile of Ezrin Knockdown in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
المؤلفون المشاركون
Zhang, Pixian
Xu, Liyan
Li, Enmin
Wu, Jianyi
Xie, Jianjun
Wu, Bingli
Du, Zepeng
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-07-14
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Ezrin, coding protein EZR which cross-links actin filaments, overexpresses and involves invasion, metastasis, and poor prognosis in various cancers including esophageal squamous cell carcinoma (ESCC).
In our previous study, Ezrin was knock down and analyzed by mRNA expression profile which has not been fully mined.
In this study, we applied protein-protein interactions (PPI) network knowledge and methods to explore our understanding of these differentially expressed genes (DEGs).
PPI subnetworks showed that hundreds of DEGs interact with thousands of other proteins.
Subcellular localization analyses found that the DEGs and their directly or indirectly interacting proteins distribute in multiple layers, which was applied to analyze the shortest paths between EZR and other DEGs.
Gene ontology annotation generated a functional annotation map and found hundreds of significant terms, especially those associated with cytoskeleton organization of Ezrin protein, such as “cytoskeleton organization,” “regulation of actin filament-based process,” and “regulation of actin cytoskeleton organization.” The algorithm of Random Walk with Restart was applied to prioritize the DEGs and identified several cancer related DEGs ranked closest to EZR.
These analyses based on PPI network have greatly expanded our comprehension of the mRNA expression profile of Ezrin knockdown for future examination of the roles and mechanisms of Ezrin.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Wu, Bingli& Xie, Jianjun& Du, Zepeng& Wu, Jianyi& Zhang, Pixian& Xu, Liyan…[et al.]. 2014. PPI Network Analysis of mRNA Expression Profile of Ezrin Knockdown in Esophageal Squamous Cell Carcinoma. BioMed Research International،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-488379
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Wu, Bingli…[et al.]. PPI Network Analysis of mRNA Expression Profile of Ezrin Knockdown in Esophageal Squamous Cell Carcinoma. BioMed Research International No. 2014 (2014), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-488379
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Wu, Bingli& Xie, Jianjun& Du, Zepeng& Wu, Jianyi& Zhang, Pixian& Xu, Liyan…[et al.]. PPI Network Analysis of mRNA Expression Profile of Ezrin Knockdown in Esophageal Squamous Cell Carcinoma. BioMed Research International. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-488379
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-488379
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)