Identification of Simple Sequence Repeat Biomarkers through Cross-Species Comparison in a Tag Cloud Representation
المؤلفون المشاركون
Chang, Hao-Teng
Huang, Jhen-Li
Pai, Tun-Wen
Hsu, Hui-Huang
Cheng, Ronshan
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-03-31
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Simple sequence repeats (SSRs) are not only applied as genetic markers in evolutionary studies but they also play an important role in gene regulatory activities.
Efficient identification of conserved and exclusive SSRs through cross-species comparison is helpful for understanding the evolutionary mechanisms and associations between specific gene groups and SSR motifs.
In this paper, we developed an online cross-species comparative system and integrated it with a tag cloud visualization technique for identifying potential SSR biomarkers within fourteen frequently used model species.
Ultraconserved or exclusive SSRs among cross-species orthologous genes could be effectively retrieved and displayed through a friendly interface design.
Four different types of testing cases were applied to demonstrate and verify the retrieved SSR biomarker candidates.
Through statistical analysis and enhanced tag cloud representation on defined functional related genes and cross-species clusters, the proposed system can correctly represent the patterns, loci, colors, and sizes of identified SSRs in accordance with gene functions, pattern qualities, and conserved characteristics among species.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Huang, Jhen-Li& Chang, Hao-Teng& Cheng, Ronshan& Hsu, Hui-Huang& Pai, Tun-Wen. 2014. Identification of Simple Sequence Repeat Biomarkers through Cross-Species Comparison in a Tag Cloud Representation. BioMed Research International،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-489814
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Huang, Jhen-Li…[et al.]. Identification of Simple Sequence Repeat Biomarkers through Cross-Species Comparison in a Tag Cloud Representation. BioMed Research International No. 2014 (2014), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-489814
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Huang, Jhen-Li& Chang, Hao-Teng& Cheng, Ronshan& Hsu, Hui-Huang& Pai, Tun-Wen. Identification of Simple Sequence Repeat Biomarkers through Cross-Species Comparison in a Tag Cloud Representation. BioMed Research International. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-489814
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-489814
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر