![](/images/graphics-bg.png)
New Insights in the Sugarcane Transcriptome Responding to Drought Stress as Revealed by Supersage
المؤلفون المشاركون
Crovella, Sérgio
Ferreira Neto, José Ribamar Costa
Benko-Iseppon, Ana Maria
Guimarães, Ana Carolina Ribeiro
Silva, Roberta Lane de Oliveira
Kido, Éderson Akio
Pandolfi, Valesca
Chabregas, Sabrina Moutinho
Veiga, Daniela Truffi
المصدر
العدد
المجلد 2012، العدد 2012 (31 ديسمبر/كانون الأول 2012)، ص ص. 1-14، 14ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-05-02
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
14
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الطب البشري
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
In the scope of the present work, four SuperSAGE libraries have been generated, using bulked root tissues from four drought-tolerant accessions as compared with four bulked sensitive genotypes, aiming to generate a panel of differentially expressed stress-responsive genes.
Both groups were submitted to 24 hours of water deficit stress.
The SuperSAGE libraries produced 8,787,315 tags (26 bp) that, after exclusion of singlets, allowed the identification of 205,975 unitags.
Most relevant BlastN matches comprised 567,420 tags, regarding 75,404 unitags with 164,860 different ESTs.
To optimize the annotation efficiency, the Gene Ontology (GO) categorization was carried out for 186,191 ESTs (BlastN against Uniprot-SwissProt), permitting the categorization of 118,208 ESTs (63.5%).
In an attempt to elect a group of the best tags to be validated by RTqPCR, the GO categorization of the tag-related ESTs allowed the in silico identification of 213 upregulated unitags responding basically to abiotic stresses, from which 145 presented no hits after BlastN analysis, probably concerning new genes still uncovered in previous studies.
The present report analyzes the sugarcane transcriptome under drought stress, using a combination of high-throughput transcriptome profiling by SuperSAGE with the Solexa sequencing technology, allowing the identification of potential target genes during the stress response.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Kido, Éderson Akio& Ferreira Neto, José Ribamar Costa& Silva, Roberta Lane de Oliveira& Pandolfi, Valesca& Guimarães, Ana Carolina Ribeiro& Veiga, Daniela Truffi…[et al.]. 2012. New Insights in the Sugarcane Transcriptome Responding to Drought Stress as Revealed by Supersage. The Scientific World Journal،Vol. 2012, no. 2012, pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-500814
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Kido, Éderson Akio…[et al.]. New Insights in the Sugarcane Transcriptome Responding to Drought Stress as Revealed by Supersage. The Scientific World Journal No. 2012 (2012), pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-500814
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Kido, Éderson Akio& Ferreira Neto, José Ribamar Costa& Silva, Roberta Lane de Oliveira& Pandolfi, Valesca& Guimarães, Ana Carolina Ribeiro& Veiga, Daniela Truffi…[et al.]. New Insights in the Sugarcane Transcriptome Responding to Drought Stress as Revealed by Supersage. The Scientific World Journal. 2012. Vol. 2012, no. 2012, pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-500814
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-500814
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)