Identification of Cassava MicroRNAs under Abiotic Stress
المؤلفون المشاركون
Rodríguez-Zapata, Fausto
Ayling, Sarah
Ballén-Taborda, Carolina
Tohme, Joe
Becerra Lopez-Lavalle, Luis Augusto
Plata, Germán
Duitama, Jorge
المصدر
International Journal of Genomics
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-11-14
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الأحياء
الملخص EN
The study of microRNAs (miRNAs) in plants has gained significant attention in recent years due to their regulatory role during development and in response to biotic and abiotic stresses.
Although cassava (Manihot esculenta Crantz) is tolerant to drought and other adverse conditions, most cassava miRNAs have been predicted using bioinformatics alone or through sequencing of plants challenged by biotic stress.
Here, we use high-throughput sequencing and different bioinformatics methods to identify potential cassava miRNAs expressed in different tissues subject to heat and drought conditions.
We identified 60 miRNAs conserved in other plant species and 821 potential cassava-specific miRNAs.
We also predicted 134 and 1002 potential target genes for these two sets of sequences.
Using real time PCR, we verified the condition-specific expression of 5 cassava small RNAs relative to a non-stress control.
We also found, using publicly available expression data, a significantly lower expression of the predicted target genes of conserved and nonconserved miRNAs under drought stress compared to other cassava genes.
Gene Ontology enrichment analysis along with condition specific expression of predicted miRNA targets, allowed us to identify several interesting miRNAs which may play a role in stress-induced posttranscriptional regulation in cassava and other plants.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Ballén-Taborda, Carolina& Plata, Germán& Ayling, Sarah& Rodríguez-Zapata, Fausto& Becerra Lopez-Lavalle, Luis Augusto& Duitama, Jorge…[et al.]. 2013. Identification of Cassava MicroRNAs under Abiotic Stress. International Journal of Genomics،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-503878
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Ballén-Taborda, Carolina…[et al.]. Identification of Cassava MicroRNAs under Abiotic Stress. International Journal of Genomics No. 2013 (2013), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-503878
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Ballén-Taborda, Carolina& Plata, Germán& Ayling, Sarah& Rodríguez-Zapata, Fausto& Becerra Lopez-Lavalle, Luis Augusto& Duitama, Jorge…[et al.]. Identification of Cassava MicroRNAs under Abiotic Stress. International Journal of Genomics. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-503878
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-503878
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر