RNA 2D structure prediction : a review

الملخص FRE

L’ARN, une macromolécule assurant plusieurs fonctions biologiques : Traduction des gènes en protéines, régulation de l’expression génique, structure 3D et fonction des ARN, etc.

Dans ce travail, nous allons passer en revue la prédiction des structures secondaires des ARN par programmation dynamique en s’appuyant sur l’algorithme classique de Nussinov.

Nous avons pris en compte quatre possibilité de liaisons entre les nucléotides formant la chaîne polymérique de l’ARN (liaisons canoniques GC, CG, AU UA, liaisons wobble : GU ou UG, etc.).

Le programme testé dans ce travail montre que l’algorithme dévelppé prédit correctement les différentes paires de bases qui entrent dans la structure 2D de l’ARN.