Molecular detection of astrovirus using reverse transcriptase quantitative polymerase chain reaction technique
العناوين الأخرى
التحري الجزيئي للفايروس النجمي باستخدام تقنية تفاعل سلسلة البلمرة عكس الاستنساح اللحظي
المؤلفون المشاركون
al-Hamdani, Faysal Ghazi
Fadil, Hala Yunus
Abd al-Karim, Mais Jasim
Awfi, Iman Mutashshar
المصدر
The Iraqi Journal of Agricultural Science
العدد
المجلد 51، العدد (s) (31 يناير/كانون الثاني 2020)، ص ص. 191-200، 10ص.
الناشر
تاريخ النشر
2020-01-31
دولة النشر
العراق
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الموضوعات
الملخص EN
This study was aimed to highlight the importance of the melt curve-quantitative reverse transcriptase PCR (RT-qPCR) analysis in the detection of astrovirus (AstV) from both negative and positive rotavirus and enterovirus (EVs) samples, and the effectiveness of the AstV infection on the vaccine immunogenicity in the vaccinated infected children.
By RT-qPCR based Sybre green associatedmelting curve assay, stool samples of 49 enterovirus suspected patients and of 39 rotavirus suspected patients were tested for AstV.
Results of EVs group showed a 29 (59.2%) positive AstV contributed to 26 (89.5%) co-infection with Evs and 3 (10.3%) as a single infection in negative samples for Evs.
Furthermore, AstV co-infection percentage is higher than the single infection.
Moreover, the percentage of the Astrovirus among the vaccinated AFP-suspected cases was 53%, while the percentage of these viruses among the unvaccinated was 100%.
Thus, MamAstrovirus- 1 MK948878 is the first local isolate recorded in the Genbank.
In conclusion, the RT-qPCR based on SYBR Green showed the rapid and efficient detection of AstV with few copies number.
This allow to be used for the diagnosis of AstV along with other gastroenteritis viruses in a multiplex assay to reduce processing time.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Fadil, Hala Yunus& Abd al-Karim, Mais Jasim& Awfi, Iman Mutashshar& al-Hamdani, Faysal Ghazi. 2020. Molecular detection of astrovirus using reverse transcriptase quantitative polymerase chain reaction technique. The Iraqi Journal of Agricultural Science،Vol. 51, no. (s), pp.191-200.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-948729
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Fadil, Hala Yunus…[et al.]. Molecular detection of astrovirus using reverse transcriptase quantitative polymerase chain reaction technique. The Iraqi Journal of Agricultural Science Vol. 51, Special Issue (2020), pp.191-200.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-948729
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Fadil, Hala Yunus& Abd al-Karim, Mais Jasim& Awfi, Iman Mutashshar& al-Hamdani, Faysal Ghazi. Molecular detection of astrovirus using reverse transcriptase quantitative polymerase chain reaction technique. The Iraqi Journal of Agricultural Science. 2020. Vol. 51, no. (s), pp.191-200.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-948729
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references : p. 198-200
رقم السجل
BIM-948729
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر