Molecular characterization of carbapenem resistance in clinical isolates of Acinetobacter baumannii and therapeutic options

مقدم أطروحة جامعية

Hamdan, Murad Sulayman

مشرف أطروحة جامعية

Farraj, Muhammad

الجامعة

جامعة بيرزيت

الكلية

كلية الصيدلة و التمريض و المهن الصحية

دولة الجامعة

فلسطين (الضفة الغربية)

الدرجة العلمية

ماجستير

تاريخ الدرجة العلمية

2019

الملخص العربي

A baumannii عصيات سلبية الصبغة تتميز بعدم الحركة، oxidase سالبة هذه الجرثومة لها القدرة على اصابة المرضى في المستشفيات و خاصة كبار السن و الرضع و الذين يعانون من نقص المناعة مما يسبب التهابات شديدة مع.

حدة الاعراض و ارتفاع معدلات الوفيات A baumannii لها دور بارز في التسبب في الالتهاب الرئوي لمرضى المستشفيات خاصة بين المرضى في وحدات العناية المركزة.

تم تصنيف baumamii .4 كواحدة من أهم ستة كان كائنات دقيقة مقاومة للأدوية المتعددة في المستشفيات في جميع أنحاء العالم.

على الرغم من مقاومتها لجميع المضادات الحيوية المعروفة، إلا أن معظم السلالات تظل حساسة للكاربا بينيمات.

لذلك تقتصر خيارات العلاج على الكاريا بينيمات، الكوليستين و Tigecycline .

الهدف من هذه الدراسة هو الكشف عن العزلات الإكلينيكية المنتجة للانزيمات التي تبطل مفعول الكاربابينيمات أجريت الدراسة على 59 مريضا من مستشفيات وعيادات خارجية في جميع أنحاء الضفة الغربية في فلسطين.

تم جمع العينات بين أكتوبر 2016 ونوفمبر 2017 تم الحصول على عزلات A baumammit.

السريرية من اماكن مختلفة من المرضى بما في ذلك البول و الجروح و الدم و البلغم و نضح القصبة الهوائية.

تم إجراء اختبار الحساسية المختلفة للمضادات الحيوية باتباع مبادئ CLSI.

كما تم إجراء PCR لتحديد وجود الجينات التي لها علاقة في مقاومة الكاربينيمات الجينات التي تم اختبارها تشمل OXA 51 beta lactamases و 23 OXA و 24 OXA و 58 OXA.

أشارت النتائج أن جميع العزلات كانت مقاومة لميروبينيم بينما كانت نسبة الحساسية للكوليستين و التايجيسايكلين %84.7 ( 50/59 ) و %88.1 ( 59/52 ) على التوالي.

أظهرت نتائج PCR أن جميع الجينات blaOXA51 كانت تحملها جميع العزلات بينما كانت نسبة blaOXA23 تعادل 54.2 ( 59/32 ).

لم يحمل أي من عزلات Acinetobacter جينات blaOXA24 و blaOXA58..

من المعروف ان جين blaOXA51 يستخدم للتاكد من صحة التعرف على A baumamii.

فيما يتعلق بالجينات blaOXA24 و blaOXA58، فمن خلال المقالات العلمية المنشورة، فان عزلات A baumamii التي تحمل أيا من هذين الجينين تظهر مقاومة للكاريا بينيمات.

مع ان الجدير بالذكر بان انتشارهما محدود في مناطق معينة في العالم مثل إسبانيا و فرنسا.

فيما يتعلق بـ 23-blaOXA، تتفق نتائج هذا البحث مع المقالات المنشورة المتعلقة بانتشار مقاومة الكاريابينيمات في عزلات A.

baumannii التي تحمل هذا الجين.

الملخص الإنجليزي

Acinetobacter baumannii is gram negative coccobacilli characterized by being non-motile, oxidase negative.

It has been recognized to colonize hospitalized patients particularly the elderly, infants and the immunocompromised thus causing severe infections with high morbidity and mortality.

A.

baumannii plays a predominant role in causing nosocomial pneumonia particularly the ventilation-related pneumonia seen among patients in intensive care units.

A.

baumannii has been classified as one of the six most important multidrug-resistant microorganisms in hospitals worldwide.

Although its resistance to all known antibiotics has appeared, most strains remain susceptible to carbapenems.

Therefore, treatment options are limited to carbapenems, colistin and Tigecycline.

The aim of this study was to screen for carbapenemase producing A.

baumannii clinical isolates.

The study has been conducted on 59 hospitalized patients and outpatients attending clinics throughout the West Bank, Palestine.

The samples were collected between October 2016 and November 2017.

Acinetobacter baumannii clinical isolates were obtained from different sources including urine, wound, blood, sputum and tracheal aspirates.

Antibiotic susceptibility testing by the disk diffusion method and minimal inhibitory concentration by the microbroth dilution method was performed following the guidelines of the Clinical and Laboratory Standards Institute.

Polymerase gene reaction was performed to determine the genes involved in carbapenem resistance.

The genes tested include the OXA-b-lactamases; OXA 51, OXA 23, OXA 24 and OXA 58.

The results obtained indicated that all isolates were resistant to Meropenem.

Susceptibility to colistin and Tigecycline were 84.7% (50/59) and 88.1% (52/59) respectively PCR results showed that all blaOXA51 gene was carried by all isolates while blaOXA523 gene was carried by 54.2% (32/59) of isolates.

None of the Acinetobacter isolates tested carried the blaOXA24 and blaOXA58 genes.

blaOXA51 gene has been found to be carried by all strains of A.

baumannii and usually used to confirm the identification of the clinical isolates.

Regarding the blaOXA24 and blaOXA58 genes, it has been reported that A.

baumannii carrying these two genes show have resistance to carbapenems.

However, these two genes are are not universally spread but reported in certain areas in the world such as Spain and France.

Regarding blaOXA-23, our finding is consistent with published literature regarding the spread of carbapenem resistance in A.

baumannii isolates carrying this gene.

التخصصات الرئيسية

التمريض

الموضوعات

• المضادات الحيوية
• الراكدة البومانية

عدد الصفحات

43

قائمة المحتويات

• APA
• MLA
• AMA

لغة النص

الإنجليزية

نوع البيانات

رسائل جامعية

رقم السجل

BIM-957350