The association between genetic variations of KCNj11 gene and type 2 diabetes mellitus in a sample of Iraqi population
Other Title(s)
العلاقة بين الاختلافات الجينية لجين KCNj11 و داء السكري من النوع 2 في عينة من السكان العراقيين
Joint Authors
al-Husayni, Bushra Ariabi
al-Sahlawi, Mahdi M. Rida
Source
al-Kufa University Journal for Biology
Issue
Vol. 13, Issue 2 (31 Aug. 2021), pp.26-38, 13 p.
Publisher
University of Kufa Faculty of Science Department of live Sciences
Publication Date
2021-08-31
Country of Publication
Iraq
No. of Pages
13
Main Subjects
Topics
Abstract AR
داء السكري من النوع 2 هو اضطراب متعدد الجينات ينشأ نتيجة تفاعل معقد بين جينات متعددة و عوامل بيئية.
يقوم الجين KCNJ11 بتشفير بروتين Kir6.2 الذي يشكل القسم الداخلي لقنوات البوتاسيوم في خلايا بيتا البنكرياس.
الطريقة: تضمنت دراسة الحالات و الشواهد هذه 300 مريض من النوع T2DM و 300 عنصر تحكم سليم.
تم التنميط الجيني لتعدد الأشكال KCNJ11 rs5215 و rs5210 عن طريق تعدد الأشكال لطول جزء التقييد (RFLP).
النتائج: إحصائيات معادلة هاردي و اينبرغ للأنماط الجينية KCNJ11 rs5210 (A / G) SNP بين المرضى موضوعات التحكم ذات دلالة عالية (P <0.001).
مقارنة بين الأنماط الجينية KCNJ11 rs5210 (A / G) SNP نموذج الترميز النموذج الإضافي النموذج المتنحي ولم يظهر أي اختلاف كبير بين مجموعات التحكم و المرضى (ع = 0.564) (ع = 0.806) و (ع = 0.284) على التوالي.
أكد عدم وجود ارتباط كبير (ع = 0.589).
لم يظهر تحليل الأليلات أي ارتباط مهم (ع = 0.432).
تعتبر المقارنة بين مؤشر كتلة الجسم و HDL مهمة بالنسبة للأنماط الجينية لـ KCNJ11 rs5210 (A / G) على أساس نموذج الترميز و الكيمياء الحيوية الأخرى ليست كذلك.
إحصائيات معادلة هاردي و اينبرغ لـ KCNJ11 rs5215 (C: I / T: V) الأنماط الجينية SNP بين المرضى تتحكم بشكل كبير (P <0.001).
لم يظهر نموذج المشاركة أي فرق كبير (ع = 0.835).
لم يظهر النموذج السائد و النموذج المتنحي و النموذج الإضافي أي فرق معنوي (p = 0.581) و (p = 0.606) و (p = 0.483).
لم يظهر تحليل الأليل أي فرق كبير (ع = 0.463).
المقارنة بين مؤشر كتلة الجسم و الكوليسترول ليست مهمة للأنماط الجينية KCNJ11 rs5215 (C / T) SNP على أساس نموذج الترميز و الكيمياء الحيوية الأخرى مهمة.
الارتباط بين خطر الإصابة بالمرض و الأنماط الفردانية الناتجة عن تفاعل KCNJ11 rs5210 (A / G) مقابل تفاعل rs5115 (C: I / T: V) هو H 1 ارتبط النمط الفرداني H2 بخطر كبير للإصابة بالمرض (p = 0.004) أو 1.64 (p <0.001) مع OR 0.35.
ارتبط النمط الفرداني H3 بحماية كبيرة ضد المرض (p = 0.024) مع نسبة OR تقريبية تبلغ 0.69.
ارتبط وجود الأنماط الفردانية H4 بخطر كبير للمرض (P <0.001) مع نسبة أرجحية تبلغ 2.52.
Abstract EN
Type 2 diabetes mellitus is a polygenic disorder that develops as a result of a complex interaction between multiple genes and environmental factors.
KCNJ11 gene encodes a Kir6.2 protein which forms the inner section of the potassium channels in pancreatic beta cells.
Methods: This case-control study involved 300 T2DM patients and 300 healthy controls.
The KCNJ11 rs5215 and rs5210 polymorphism was genotyped by Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP).
Results: Hardy Weinberg equation statistics of KCNJ11 rs5210 (A/G) SNP genotypes among patients, control subjects highly significant (p < 0.001).
Comparison of KCNJ11 rs5210 (A/G) SNP genotypes the codominance model, the additive model The recessive model and has shown no significant variation between control and patient groups (p = 0.564), (p = 0.806)and (p = 0.284) respectively.
confirmed the lack of significant association (p = 0.589).
Analysis of alleles has shown no significant association (p = 0.432).
Comparison of BMI and HDL is significant to KCNJ11 rs5210 (A/G) SNP genotypes based on codominance model and other biochemical is not.
Hardy Weinberg equation statistics of KCNJ11 rs5215 (C: I /T: V) SNP genotypes among patients, control highly significant (p < 0.001).
The codominance model has shown no significant difference (p =0.835).
The dominant model, the recessive model and the additive model has shown no significant difference (p =0.581), (p =0.606) and (p =0.483).
Allele analysis has shown no significant difference (p =0.463).
Comparison of BMI and cholesterol is no significant to KCNJ11 rs5215 (C/T) SNP genotypes based on codominance model and other biochemical is significant.
The association between risk of disease and haplotypes resulting from KCNJ11 rs5210 (A/G) versus rs5115 (C: I /T: V) interaction is H 1, H2 haplotypes was associated with highly significant risk of disease (p = 0.004) OR of 1.64, (p < 0.001) with an OR of 0.35.
H 3 haplotypes was associated with significant protection against the disease (p = 0.024) with an approximate OR of 0.69.
The presence of H 4 haplotypes was associated with highly significant risk of the disease (p < 0.001) with an OR of 2.52.
American Psychological Association (APA)
al-Husayni, Bushra Ariabi& al-Sahlawi, Mahdi M. Rida. 2021. The association between genetic variations of KCNj11 gene and type 2 diabetes mellitus in a sample of Iraqi population. al-Kufa University Journal for Biology،Vol. 13, no. 2, pp.26-38.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1258549
Modern Language Association (MLA)
al-Husayni, Bushra Ariabi& al-Sahlawi, Mahdi M. Rida. The association between genetic variations of KCNj11 gene and type 2 diabetes mellitus in a sample of Iraqi population. al-Kufa University Journal for Biology Vol. 13, no. 2 (2021), pp.26-38.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1258549
American Medical Association (AMA)
al-Husayni, Bushra Ariabi& al-Sahlawi, Mahdi M. Rida. The association between genetic variations of KCNj11 gene and type 2 diabetes mellitus in a sample of Iraqi population. al-Kufa University Journal for Biology. 2021. Vol. 13, no. 2, pp.26-38.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1258549
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 37-38
Record ID
BIM-1258549