Genetic diversity among some Aspergillus flavus isolates by using inter simple sequence repeats (ISSR)‎

Other Title(s)

التغايرات الوراثية بين بعض عزلات Aspergillus flavus باستخدام تقني (ISSR)‎

Joint Authors

al-Judi, Nimat Jamil Abd al-Baqi
al-Jabburi, Muna Hammudi
Abd al-Latif, Safa Mujahid

Source

Iraqi Journal of Science

Issue

Vol. 55, Issue 3A (30 Sep. 2014), pp.986-993, 8 p.

Publisher

University of Baghdad College of Science

Publication Date

2014-09-30

Country of Publication

Iraq

No. of Pages

8

Main Subjects

Biology

Topics

Abstract AR

عزلات فطر الرشاشيات الخضراء (A.flavus) تم إعادة تشخيصها اعتمادا على شكل الكونيديات مجهريا و لون الخيوط الفطرية طبقيا.

تم الكشف الأولي لقابلية الفطر على إنتاج سم الأفلاتوكسين (Aflatoxin B1) بواسطة الأوساط المحفزة لإنتاج السم و التي تضمنت الوسط التفريقي (AFPA)، أثبتت سبعة عزلات من ضمن أحد عشر قابليتها على إنتاج الأفلاتوكسين و ذلك بتكوين حلقة برتقالية اللون.

استخدمت التقنيات الجزئية للكشف عن التغايرات بين العزلات عن طريق التغاير بالدنا، حيث أن تغاير الدنا قد بين قابلية العزلات على إنتاجها للأفلاتوكسين و العلاقات الوراثية ما بين العزلات و من أهم هذه التقنيات (ISSR)، استخدمت ثلاث بادئات صممت من قبل جامعة (University of British Columbia) التي أنتجت 18 حزمة أصلية من ضمنها 58 حزمة متعددة الأشكال و ذات حجم ما بين 100–1500 زوج من القواعد النيتروجينية و قيمة التغايرات الوراثية لكل بادئ وضعت بين مدى و مقداره 16.9–74.4 %.

مصطلح الحزمة المفردة تمثل البصمة الوراثية للعزل، حزمة مفردة واحدة أنتجت من العزلة الخامسة للبادئ رقم (UBC809) البعد الوراثي للعزلات كان بين مدى (0.93644–0.12599)، و وضحت العلاقة بين العزل على المخططات العنقودية (الديندروكرام) الذي ميز العزلات اعتمادا على مصدر العزل.

Abstract EN

Aspergillus flavus isolates which are considered on conidial shape through microscopic examination and mycelial colour through cultural properties.

Primary screening for the ability of A.

flavus isolates for aflatoxin production was determined using A.

flavus parasiticus agar medium (AFPA) as well, 7 isolates from 11 isolates give a positive result by the presence of bright yellow-orange pigments indicated the presence of aflatoxins.

Molecular genetics techniques using DNA polymorphism have been increasingly used to characterize and identify genetic diversity and relationships among eleven A.

flavus isolated from different source using the ISSR (inter simple sequence repeats) technique.

Three universal primers designed at University of British Columbia (UBC 809, UBC 810, UBC 811) were produced (18) main bands of these bands, 53 bands were polymorphic.

The size of the amplified bands ranged between 100-1,500 bp.

The genetic polymorphism value of each primer was ranged between 16.98-74.4 %.

In terms of unique banding patterns, determine the finger print for one isolate the most characteristic banding pattern was for the isolate number 5 with primer UBS primer No.

809.

Genetic distances ranged from 0.12599 to 0.93644 among A.

flavus isolates.

Cluster analyses were performed to construct a dendrogram placed most of the A.

flavus was isolated from the different source at the same main group.

American Psychological Association (APA)

Abd al-Latif, Safa Mujahid& al-Jabburi, Muna Hammudi& al-Judi, Nimat Jamil Abd al-Baqi. 2014. Genetic diversity among some Aspergillus flavus isolates by using inter simple sequence repeats (ISSR). Iraqi Journal of Science،Vol. 55, no. 3A, pp.986-993.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-394322

Modern Language Association (MLA)

Abd al-Latif, Safa Mujahid…[et al.]. Genetic diversity among some Aspergillus flavus isolates by using inter simple sequence repeats (ISSR). Iraqi Journal of Science Vol. 55, no. 3A (2014), pp.986-993.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-394322

American Medical Association (AMA)

Abd al-Latif, Safa Mujahid& al-Jabburi, Muna Hammudi& al-Judi, Nimat Jamil Abd al-Baqi. Genetic diversity among some Aspergillus flavus isolates by using inter simple sequence repeats (ISSR). Iraqi Journal of Science. 2014. Vol. 55, no. 3A, pp.986-993.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-394322

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references : p. 992-993

Record ID

BIM-394322