التنميط الوراثي لبعض العزلات الفطرية اعتمادا على التغاير في منطقة ITS ( internal transcribed spacer) كشفرة وراثية عالمية في تشخيص الفطريات
Joint Authors
Source
مجلة جامعة بابل : العلوم الصرفة و التطبيقية
Issue
Vol. 24, Issue 1 (31 Mar. 2016), pp.61-73, 13 p.
Publisher
Publication Date
2016-03-31
Country of Publication
Iraq
No. of Pages
13
Main Subjects
Topics
Abstract AR
هدفت الدراسة إلى تطبيق تقنية التشخيص الجزيئي اعتماد على التغاير في منطقة ITS region لتأكيد تشخيص بعض العزلات الفطرية، فقد استخدمت الشفرة الجينية المعتمدة عالميا كمستوى تشخيصي جزيئي متقدم قياسا بالطرائق التشخيصية التقليدية المظهرية و المجهرية.
و شملت الدراسة خمس عزلات فطرية حيث شخصت العزلات المنتخبة التابعة لأجناسUlo.
alternaria.(1) ، T.harzianum.(1)، p.oxalicum.(1) ،A.flavus.(1) ،A.niger.(2) التي تعود لصف الفطريات الناقصة، و قد تم استخلاص ال DNA و تضخيم منطقة الهدف (ITS1 5.8S ITS2) في rDNA و باستخدام الزوج البادئITS4–ITS1 الذي ضخم و بنجاح منطقة الهدف و لجميع العزلات المختبرة، و انعكس ذلك بظهور خمس حزم على الهلام بأوزان جزيئية مختلفة.
أكدت نتائج تضخيم تفاعل البلمرة المتسلسل وجود تباين في الحزم و لجميع العزلات الفطرية المختلفة و التي تراوحت بين 625-496 زوجا قاعديا.
فقد سجلت عزلات الجنسT.harzianum.(1) أكبر وزن جزيئي 625 زوجا قاعديا، و سجلت عزلة الجنس A.
niger.(2) وزن جزيئي 599 زوجا قاعديا في حين سجل A.flavus.(1) وزن جزيئي 595 زوجا قاعديا.
و قد سجلت عزلة الفطر p.oxalicum.(1) وزن جزيئي575 زوجا قاعديا، في حين سجل الجنس Ulo.
alternaria.(1) اقل وزن جزيئي تراوح بين 496-498 زوجا قاعديا.
و خلصت دراسة التنميط الوراثي إلى أن تقنيات التنميط نجحت في تشخيص العزلات بشكل مميز عند منطقة ال ITS حيث أظهرت خمس حزم مختلفة نتيجة لاختلاف الأنواع و الأجناس للعزلات المختبرة، و قد توافقت و أكدت نتائج هذه الدراسة التشخيص المجهري و المظهري لهذه العزلات.
و توصي الدراسة باعتماد هذه التقنية في الدراسات التصنيفية الجزيئية بعدها طريقة تشخيصية متقدمة و كذلك دقيقة و سريعة.
Abstract EN
This study aimed to use ITS ( internal transcribed spacer) region as a universal DNA barcode in identifying some fungal strains to confirm molecular diagnosis .
Five strains from deuteromycetes class have been selected.Aspergillus niger .(2), Aspergillus flavus .(1) , Pencillum oxalicum.(1), Trighoderma harzianum.(1) , Ulocladium alternaria.(1) DNA of the five strains have been extracted, and the target region (ITS1 5.8S ITS2) of the rDNA has been amplified by using the universal primers ITS1 – ITS4.
The gel photo visualized five bands in different molecular size between 496-625 bp.
The difference in bands size refer to the genetic diversity among the strains which were as following, Trighoderma harzianum.(1) 625 bp, .Aspergillus niger .(2) 599 bp, Aspergillus flavus .(1) 595 bp, Pencillum oxalicum.(1)575 bp,.
Ulocladium alternaria.(1) 496-498 bp.
The study has been successfully identify the five strains according to the genetics differences in ITS region which Compatible with microscopic and morphological identification, thus, this study recommended using a molecular studies which is more accurate and quick identification compare with the traditional one in fungai
American Psychological Association (APA)
ماهر نعيم محمد وعلاء عيدان حسن. 2016. التنميط الوراثي لبعض العزلات الفطرية اعتمادا على التغاير في منطقة ITS ( internal transcribed spacer) كشفرة وراثية عالمية في تشخيص الفطريات. مجلة جامعة بابل : العلوم الصرفة و التطبيقية،مج. 24، ع. 1، ص ص. 61-73.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-684836
Modern Language Association (MLA)
ماهر نعيم محمد وعلاء عيدان حسن. التنميط الوراثي لبعض العزلات الفطرية اعتمادا على التغاير في منطقة ITS ( internal transcribed spacer) كشفرة وراثية عالمية في تشخيص الفطريات. مجلة جامعة بابل : العلوم الصرفة و التطبيقية مج. 24، ع. 1 (2016)، ص ص. 61-73.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-684836
American Medical Association (AMA)
ماهر نعيم محمد وعلاء عيدان حسن. التنميط الوراثي لبعض العزلات الفطرية اعتمادا على التغاير في منطقة ITS ( internal transcribed spacer) كشفرة وراثية عالمية في تشخيص الفطريات. مجلة جامعة بابل : العلوم الصرفة و التطبيقية. 2016. مج. 24، ع. 1، ص ص. 61-73.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-684836
Data Type
Journal Articles
Language
Arabic
Notes
يتضمن مراجع ببليوجرافية : ص. 71-73
Record ID
BIM-684836
