Characterization of h5 hemagglutinin of h5n1 avian influenza virus in the middle east
Other Title(s)
وصف الجين المخثر H5 لفيروس انفلونزا الطيور H5 N1 في الشرق الأوسط
Author
Source
IUG Journal of Natural Studies
Issue
Vol. 17, Issue 1 (31 Jan. 2009), pp.47-60, 14 p.
Publisher
The Islamic University-Gaza Deanship of Research and Graduate Affairs
Publication Date
2009-01-31
Country of Publication
Palestine (Gaza Strip)
No. of Pages
14
Main Subjects
Topics
Abstract AR
لقد تم استرجاع سلاسل النيوكلتيدات والأحماض الأمينية ل 76 سلالة أنفلونزا الطيور نوع H5N1 من قاعدة البيانات في بنك الجينات.
كانت 53 سلالة قد تم عزلها من دول في الشرق الأوسط، أما السلالات الأخرى كانت ممثلة لآسيا، أوروبا، أفريقيا، و أمريكا الشمالية.
تحليل تطور السلالات و المقارنة لسلاسل الأحماض الأمينية للجين H5 كشفت أن فيروسات H5N1 المتواجدة في الشرق الأوسط على درجة عالية من التشابه.
مقارنة سلاسل الأحماض الأمينية فقد أظهر أن موقع الانشطار يحتوي على العديد من الأحماض الأمينية القاعدية و هذا ما يفسر خاصية الأمراضية الشديدة لدى هذه السلالات.
كما أظهرت مقارنة سلاسل الأحماض الأمينية أن الجيب لخاص الذي يرتبط مع المستقبل يحتوي على الحامضين الأمينيين جلوتامين (238) و جلايسين( 240 ) مما يشير إلى تفضيلية الارتباط مع المستقبلات ذات العلاقة بفيروسات أنفلونزا الطيور.
تحليل تطور السلاسلات فقد أظهر أن سلاسلات H5N1 المتواجدة في الشرق الأوسط تنتمي لذرية Qinghai أو Astrakhan و اللتان تنتميان لزميرة (EMA أو 2.2)، كذلك أثبتت الدراسة أن فيروسات H5N1 المتواجدة في الشرق الأوسط تنتميان إلى تحت زميرتين هما (EMA-1) 2.2.1 و (EMA-3) 2.2.3.
Abstract EN
Fifty three of Middle East avian influenza virus H5N1 strains were retrieved from Gen Bank Database.
Other 23 H5N1 representative strains from Asian, Europe, Africa, and North America were also used in this study.
Phylogenetic analysis and pairwise comparison of nucleotide and amino acid sequences of.
Hem agglutinin (HA) gene region of these strains revealed that the H5N1 viruses circulating in Middle East displayed high similarity.
The HA protein of the virus contained multiple basic amino acid residues (QGERRRKKR) or (QGEGRRKKR) adjacent to the cleavage site between the HA1 and HA2 domains, showing the highly pathogen characteristics.
Further analyses of these H5N1 strains showed that all of them carried (Gln) 238Q and HA (Gly) 240G at the receptor binding pocket which indicates preferential binding to alpha-2, 3-NeuAcGal receptors.
Phylogenetic analysis also confirmed that these H5N1 viruses belonged to the Qinghai lineage or Astrakhan lineage of highly pathogenic avian influenza (HPAI) viruses H5N1 (subclade 2.2 or EMA).
As a result, 2 closely related but distinguishable H5N1 sub-subclades are defined and called (2.2.1 (EMA-1) and 2.2.3(EMA3).
American Psychological Association (APA)
Adwan, Ghalib M.. 2009. Characterization of h5 hemagglutinin of h5n1 avian influenza virus in the middle east. IUG Journal of Natural Studies،Vol. 17, no. 1, pp.47-60.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-9740
Modern Language Association (MLA)
Adwan, Ghalib M.. Characterization of h5 hemagglutinin of h5n1 avian influenza virus in the middle east. IUG Journal of Natural Studies Vol. 17, no. 1 (Jan. 2009), pp.47-60.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-9740
American Medical Association (AMA)
Adwan, Ghalib M.. Characterization of h5 hemagglutinin of h5n1 avian influenza virus in the middle east. IUG Journal of Natural Studies. 2009. Vol. 17, no. 1, pp.47-60.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-9740
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 57-59
Record ID
BIM-9740
